проверени факти доверлив извор
напишано од истражувач(и)
лекторирани
од Рис Томас Вајт, Дејвид Винтер и Сузан Менинг, Разговор
Секој кој поминал време во единицата за неонатална интензивна нега (NICU) знае дека тоа е интензивно.
За малите бебиња згрижени во овие одделенија, секоја инфекција може да се покаже како фатална. Се посветува големо внимание за да се спречи ширењето на патогени микроорганизми, но сè уште се појавуваат епидемии.
Традиционално, откривањето на епидемии во NICU е реактивно – само откако повеќе бебиња ќе се разболат во исто време.
Нашето истражување ја унапредува употребата на технологии за секвенционирање на целиот геном за рано откривање на епидемии и елиминирање на бактериите пред да им се закануваат на повеќе бебиња.
Надзорот на епидемијата на NICU обично вклучува следење на стапките на болеста и идентификување на шила и долгорочни трендови кои може да укажат на патоген кој циркулира на одделението.
Кога ќе се идентификува потенцијална епидемија, бактериите може да се култивираат и ретроспективно да се секвенционираат за да се утврди дали може да се поврзат со заеднички извор или пренос на одделението.
Регионалната болница Велингтон го промени својот пристап кон надзорот на инфекции во НИЦУ. Наместо да чекаат доенчињата да се разболат, тие ја користат истата технологија за секвенционирање што ја развивме во Институтот за наука и истражување на животната средина (ESR) за следење на геномскиот контакт за време на пандемијата на COVID.
Доенчињата во единицата земаат дијагностички примероци од брис како дел од рутинската пракса. Доколку се одгледуваат некои клучни бактерии од овие примероци, тие веднаш се секвенционираат за да се идентификуваат можните настани на пренос во скоро реално време. Ова ни овозможува внимателно да ја следиме ситуацијата и брзо да реагираме на новите епидемии.
Бидејќи сите доенчиња кои носат одреден бактериски сој нема да доживеат тешка инфекција, овој проактивен пристап може да открие избувнување пред кое било бебе да се разболи.
И бидејќи секвенционирањето на целиот геном ја декодира целата генетска структура на бактериите, исто така му дава на тимот на NICU информации за тоа како патогените се поврзани едни со други. Ова им овозможува да ги разликуваат еднократните футроли увезени во единицата од сите што циркулираат во него.
Ова ниво на детали овозможува прецизно следење на инфекцијата и брзи, информирани одлуки за контрола на епидемијата.
Оваа промена неодамна беше тестирана кога проактивниот геномски надзор покажа дека две доенчиња во NICU имале инфекции на очите предизвикани од истиот организам, невообичаен вид на Staphylococcus aureus (MRSA) отпорен на метицилин.
MRSA е позната по својата отпорност на вообичаени антибиотици, што ја прави особено опасна во болниците.
Секвенционирањето на лице место покажа дека двата случаи најверојатно се поврзани. Приоритетите беа да се утврди дали другите доенчиња биле засегнати и да се ограничи ширењето на патогенот што е можно побрзо. Скринингот на доенчиња во НИКУ покажа дека уште шест го носат истиот вид на MRSA (иако ниту едно со сериозна болест).
Ова значеше дека овие доенчиња би можеле брзо да се изолираат и да се спречи појавата пред другите да развијат значителна инфекција. Искуството на ESR како трагачи на геномски контакт помогна да се утврди како овие инфекции се шират во единицата.
Одговорот на појава зазема ресурси и вклучува повеќе чекори, од првичната потврда на инфекцијата и нејзиниот пат на пренос до комуникација со родителите.
Овој проактивен пристап за надзор на инфекции обезбедува систем за рано предупредување. Тоа значи дека тимот на NICU може да биде уверен дека избувнувањето е во тек и да дејствува брзо за да го спречи.
Моќта на секвенционирањето на геномот се протега надвор од непосредната контрола на епидемијата.
Со споредување на геномските податоци генерирани во лабораторија со оние собрани во националните проекти за надзор, нашиот тим успеа да го покаже видот што ги предизвикал инфекциите на очите можеби се појавил во раните 1990-ти.
Овој вид полека ги акумулира гените потребни за избегнување на антибиотиците од прв избор, што го поткрепува ризикот од бактерии отпорни на антибиотици во Аотеароа Нов Зеланд.
Исто така, ја истакнавме моќта на геномијата да открива врски кога откривме дека сојот MRSA што предизвикува болест во NICU е поврзан со бактерии собрани од говеда. Ова откритие го нагласува концептот на „Едно здравје“ – идејата дека здравјето на луѓето, здравјето на животните и здравјето на животната средина се нераскинливо поврзани.
Податоците сугерираат дека бактериите од резервоарот за кравјо млеко и од бебињата во болница можеби имале заеднички предок во одреден момент.
Додека продолжуваме да го разоткриваме сложениот свет на микробите, алатките како секвенционирање на целиот геном нудат надеж во тековната битка против заразните болести. Работата во НИЦУ на регионалната болница во Велингтон е само почеток.
Од заштита на нашите најранливи новороденчиња до откривање на неверојатни врски меѓу животните на фармата и болничките пациенти, геномската технологија го менува начинот на кој се бориме со заразните болести.
Како што оваа технологија продолжува да се развива, таа ветува дека ќе игра сè поклучна улога во заштитата на јавното здравје, една ДНК секвенца во исто време.
Соочени со растечката отпорност на антибиотици и појавата на патогени, овој проактивен, геномски пристап за контрола на инфекции може да биде нашата најдобра одбрана.